Нейросеть выделила 540 млекопитающих, с наибольшей вероятностью являющихся распространителями COVID-19. Согласно модели, норки, буйволы и летучие мыши входят в 10% наиболее вероятных распространителей, что соответствует результатам лабораторных экспериментов.
Коронавирус SARS-CoV-2, вызывающий COVID-19, проникает в ткани человека и животных путем взаимодействия его спайкового белка с белком ACE2 в клетках переносчика. Различные биологические виды имеют разные версии белка ACE2, поэтому понимание того, насколько хорошо их белок связывается с белком коронавируса, может помочь предсказать, какие животные с наибольшей вероятностью могут заразиться и, возможно, распространять COVID-19.
Однако аминокислотные последовательности, составляющие ACE2, известны только для около 300 видов. Чтобы обойти это ограничение, ученые из Института экосистемных исследований Кэри в Нью-Йорке создали модель, предсказывающую, может ли белок ACE2 из 5400 видов млекопитающих достаточно сильно связываться со спайк-белком коронавируса, даже не зная их аминокислотных последовательностей ACE2.
Также в обучающие данные модели включили около 60 экологических и биологических признаков каждого вида. Эти признаки включают в себя географию обитания, степень совпадения места обитания с человеческой популяцией, продолжительность жизни, а также разнообразие рациона и массу тела представителей вида.
Полученная модель оценила вероятность распространения коронавируса каждым из 5400 рассмотренных видов млекопитающих. В 10% животных с наибольшей вероятностью вошли летучие мыши, ящеры, норки, буйволы, олени и 76 видов грызунов. Для части этих животных уже имелись экспериментальные подтверждения возможности распространения вируса, что косвенно подтверждает правильность оценок модели.
