В MIT разработали нейросеть Equidock, предсказывающую соединение двух белков. Модель может ускорить разработку лекарств в 500 раз.
Вырабатываемые иммунной системой белки — антитела — могут соединяться с вирусом для его нейтрализации. Одно из направлений в фармацевтике — создание синтетических антител, предотвращающих проникновение вируса в клетку. Для разработки таких антител необходимо найти оптимальный способ соединения белков. С учетом миллионов возможных комбинаций таких соединений данная задача является крайне труднореализуемой.
В модели MIT трехмерные структуры белков трансформируются в графы. Затем алгоритм вращает и перемещает структуры для поиска точек связывания — атомов белков, вероятность взаимодействия которых максимальна.
Генерация предсказания Equidock для пары белков занимает несколько секунд, что в 80-500 раз быстрее существующих алгоритмов.
